案例三基于代謝組學技術(shù)挖掘病毒感染宿主后代謝動態(tài)變化情況

2019年發(fā)表在Viruses雜志上的另一篇文章，采用基于Orbitrap 的非靶標和靶標代謝組學方式研究了麻痹病毒（Cricket paralysis virus, CrPV）感染昆蟲Bm5細胞后宿主代謝的動態(tài)變化情況。

研究人員發(fā)現(xiàn)，CrPV感染導致Bm5細胞的代謝具有顯著和特定階段的變化。比如，CrPV持續(xù)感染過程中葡萄糖和谷氨酰胺水平均顯著升高，隨后在致病期急劇下降。不同代謝產(chǎn)物的豐度和途徑分析進一步確定了病毒生命周期不同階段的特定代謝特征。為病毒感染宿主后的致病過程，疾病分期，以及藥物治療效果提供理論依據(jù)。

新興傳染病往往是人畜共患疾病，可以從動物傳播給人類。通過蛋白、代謝和脂質(zhì)等多組學技術(shù)可以幫助研究者還原宿主-病原體相互作用關(guān)系，從而為醫(yī)務(wù)人員和科研工作者提供理論依據(jù)。Orbitrap技術(shù)作為蛋白質(zhì)組學的金標準，其高靈敏度、高精度，高通量等特性在代謝組學和脂質(zhì)組學研究中同樣表現(xiàn)出色，可以幫助研究者在一個平臺上實現(xiàn)多種組學研究的有機結(jié)合。

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案例四病毒感染宿主藥物治療研究

目前新型病毒的診療方案發(fā)布第五版，同時各醫(yī)院所進行的“一人一方案”的救治方式，體現(xiàn)了“精準醫(yī)學”的核心思想。老藥新用的磷酸氯喹臨床上已經(jīng)顯示出明確的療效；備受矚目的瑞德西韋（Remdesivir）臨床實驗已正式開始，相信在不久的將來就會有振奮人心的消息。

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臨床試驗中不可缺少的一環(huán)就是生物樣品分析，通過受試者血漿，血清等生物樣本的分析，提供藥物在體內(nèi)藥代動力學信息，目前最主要的分析手段是通過液相-串聯(lián)質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)。同時，因新冠患者的臨床癥狀，不同的患病人群如孕婦、兒童等的治療方案存在的不同，液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)可提供治療藥物監(jiān)測數(shù)據(jù)，幫助醫(yī)生調(diào)整用藥方案和劑量。本文介紹了利用UPLC-MS/MS（Transcend TLX1-TSQ Altis）同時定量人血漿中阿扎那韋等14種抗逆轉(zhuǎn)錄病du藥物和2種聯(lián)用增效藥物Cobicistat and Ritonavir，該方法在6分鐘內(nèi)即可完成對所有化合物的定量檢測，并已根據(jù)歐洲藥品管理局的指導原則進行了充分的方法學 。16種分析物的化學結(jié)構(gòu)

根據(jù)藥物在體內(nèi)濃度進行考察，確定該方法的定量下限為2.5 ng/mL至10 ng/mL不等。準確度和重現(xiàn)性是生物分析中最重要的2項指標，采用此方法，所有藥物的日內(nèi)及日間的精密度滿足生物分析要求，部分化合物重現(xiàn)性RSD% 低至0.2%，且所有藥物的準確度均<13%。

16種分析物的疊加提取離子流圖低、中、高濃度QC準確度和重現(xiàn)性評估結(jié)果

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臨床上抗病毒治療方案中，藥物聯(lián)用是重要的治療手段之一，因此一個方法中包含多化合物檢測是必要的。Transcend TLX1聯(lián)合TSQ Altis提供的快速樣本制備，所有化合物的快速檢測，對生物樣本分析的時效性提供非常重要的技術(shù)支撐，非常適合于臨床藥代動力學和治療藥物監(jiān)測研究。

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面對來勢洶涌的疫情，全國上下正在積聚力量，攻克新型高致病性冠狀病毒。在這場沒有硝煙的戰(zhàn)“疫”中，賽默飛的每一位成員都在努力行動，為全力戰(zhàn)勝新型病毒保駕護航。

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參考資料：

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3. Nakayasu ES, Nicora CD, Sims AC, et al. MPLEx: a Robust and Universal Protocol for Single-Sample Integrative Proteomic, Metabolomic, and Lipidomic Analyses. mSystems. 2016;1(3):e00043-16. Published 2016 May 10. doi:10.1128/mSystems.00043-16?

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6. Gouget H, Noé G, Barrail-Tran A, Furlan V. UPLC-MS/MS method for the simultaneous quantification of bictegravir and 13 others antiretroviral drugs plus cobicistat and ritonavir boosters in human plasma [published online ahead of print, 2019 Dec 24]. J Pharm Biomed Anal. 2019;181:113057. doi:10.1016/j.jpba.2019.113057