蛋白質(zhì)分離純化一條街:part A-凝膠過(guò)濾層析
凝膠過(guò)濾層析(Gel Filtration Chromatography,GFC)又稱
尺寸排阻層析(Size Exclusion Chromatography,SEC)
凝膠滲透層析(Gel Permeation Chromatography,GPC)
分子篩層析(Molecular Sieve Chromatography,MSC)
注:在高效液相色譜分析中,用GFC或SEC表示凝膠過(guò)濾色譜或尺寸排阻色譜,流動(dòng)相通常是水溶液;在有機(jī)高分子分析中,常用GPC表示凝膠滲透色譜,流動(dòng)相通常是有機(jī)溶劑;在蛋白質(zhì)分離純化中用GFC或SEC表示凝膠過(guò)濾層析或尺寸排阻層析;本文以下內(nèi)容均針對(duì)蛋白質(zhì)分離,因此均以凝膠過(guò)濾層析(GFC)表示。
(1)分離機(jī)理
GFC填料是由高分子交聯(lián)而成、內(nèi)部具有網(wǎng)狀篩孔的固體顆粒,利用球狀凝膠內(nèi)的篩孔的大小,不同水力學(xué)半徑的分子在通過(guò)填料時(shí)運(yùn)行路徑存在差異,利用該差異將不同大小的蛋白質(zhì)進(jìn)行分離。
蛋白質(zhì)分子流過(guò)填充凝膠的管柱時(shí),大分子無(wú)法進(jìn)入凝膠篩孔,而只流經(jīng)凝膠及管柱間的孔隙,因此總體運(yùn)行路徑較短,從層析柱入口到出口所需時(shí)間較短;較小的分子因?yàn)檫M(jìn)入凝膠內(nèi)的篩孔,總體運(yùn)行路徑較長(zhǎng),故在管柱內(nèi)的停留時(shí)間較長(zhǎng);基于此原理可以區(qū)分大小不同的分子,亦可與已知大小的分子作比較而確定未知樣品的分子量。
注1:球形蛋白與線性分子在凝膠過(guò)濾層析中的保留行為存在差異,因此使用球形蛋白制作的分子量標(biāo)準(zhǔn)曲線不能用于明膠多肽、淀粉或其它聚合物。
(2)應(yīng)用范圍
A 蛋白質(zhì)分離,基于混合中不同蛋白質(zhì)分子尺寸大小進(jìn)行分離;
B 分子量測(cè)定,蛋白質(zhì)分子量(球形)的對(duì)數(shù)與其在凝膠過(guò)濾層析時(shí)的保留時(shí)間呈線性關(guān)系;
C 樣品脫鹽或溶劑置換。
(3)填料要求
一般狀況下,用于制備凝膠過(guò)濾層析的填料應(yīng)不吸附目標(biāo)成份,所有欲分離物質(zhì)均被洗脫出,這是凝膠層析法與其它層析法不同的地方。凝膠的材質(zhì)需為化學(xué)惰性,與分離物不能產(chǎn)生變性(denature)或是其它化學(xué)反應(yīng),最好具有能長(zhǎng)期反復(fù)使用的穩(wěn)定性,并可以在較大的pH和溫度范圍內(nèi)使用。凝膠要有一定的機(jī)械強(qiáng)度,在層析過(guò)程中才不會(huì)變形,增加機(jī)械強(qiáng)度也可使層析在較高壓力的環(huán)境進(jìn)行,縮短分離時(shí)間。
(4)凝膠過(guò)濾常用填料種類
目前常用的凝膠包括3個(gè)主要類型:
A:葡聚糖凝膠(Polydextran),商品名稱是Sephadex
Polydextran幾乎不溶于溶劑中,親水性強(qiáng),能迅速在水和電解質(zhì)溶液中膨脹,在堿性的環(huán)境中十分穩(wěn)定,所以可以用堿去除凝膠上的污染物。
Sephadex G-X,X表示葡聚糖的交聯(lián)程度,數(shù)值越大則交聯(lián)度越小,但吸水量越高,X值大致是吸水量的10倍。以Sephadex G-25為例,表示
Sephadex的分離范圍與填料粒經(jīng)和交聯(lián)度密切相關(guān),大概范圍如下:
型號(hào) 粒度(微米) 有效分離范圍(球形蛋白質(zhì))
G 10 55-166 <700
G 15 60-180 <1500
G 25 - 1000-5000
G 50 - 1500-30000
G 75 - 3000-80000
G 100 - 4000-150000
G 150 - 5000-300000
G 200 - 5000-600000
Superdex屬于葡聚糖以共價(jià)結(jié)合到交聯(lián)多孔瓊脂糖珠體上的球形凝膠,流速快、反壓低。
型號(hào) 粒度(微米) 有效分離范圍(球形蛋白質(zhì))
Superdex 30 24-44 <10000
Superdex 75 24-44 3000-70000
Superdex 200 10000-600000
B 聚丙稀酰胺凝膠(Polyacrylamide)
Polyacrylamide是一種合成凝膠,商品名Bio-Gel P,干粉顆粒狀。依膠的分離范圍不同,分成Bio-Gel P-2至Bio-Gel P-300,P后面的數(shù)字乘以1000為最大過(guò)濾限度。Polyacrylamide的化學(xué)性質(zhì)不活潑,但它在極端的pH下會(huì)被水解,水解后產(chǎn)生的COOH-具有離子交換的性質(zhì),因此pH 值應(yīng)盡量控制在2-10之間。
型號(hào) 粒度(微米) 有效分離范圍(球形蛋白質(zhì))
Bio-Gel P-2 - <1800
Bio-Gel P-4 - 800-4000
Bio-Gel P-6 - 1000-6000
Bio-Gel P-10 - 1500-20000
Bio-Gel P-30 - 2500-40000
Bio-Gel P-60 - 3000-60000
C 瓊脂糖凝膠
商品名稱Sepharose,由屬于天然凝膠,依凝膠中干膠的百分含量,分為Sepharose 2B,4B和6B。Agarose gel 是一種大孔凝膠,主要用于像核酸或病毒這些分子量400,000以上的物質(zhì),因其顆粒軟,在分離過(guò)程有時(shí)會(huì)阻塞管柱,造成流速減慢,又因其在攝氏50度以上會(huì)融化,故需于較低溫的環(huán)境中進(jìn)行層析。Agarose 做成beads后不能再脫水干燥,所以要在濕態(tài)中保存。
經(jīng)2,3-二溴丙醇反應(yīng)交聯(lián)而成的凝膠為Sepharose CL型凝膠
型號(hào) 粒度(微米) 有效分離范圍(球形蛋白質(zhì))
Sepharose 2B 70000-40000000
Sepharose 4B 60000-20000000
Sepharose 6B 10000-4000000
Sepharose CL-2B 70000-40000000
Sepharose CL-4B 60000-20000000
Sepharose CL-6B 10000-4000000
Superpose 瓊脂糖經(jīng)多次交聯(lián)形成的凝膠。
型號(hào) 粒度(微米) 有效分離范圍(球形蛋白質(zhì))
Superose 6 5000-5000000
Superose 12 1000-300000
其它凝膠:聚丙稀酰胺葡聚糖凝膠,交聯(lián)聚苯乙烯凝膠,聚乙烯醇凝膠等,還有更多新型號(hào)的凝膠。
4 操作實(shí)例(轉(zhuǎn)載)
1) 凝膠溶脹
凝膠顆粒要求大小比較均勻 ,可流速穩(wěn)定,結(jié)果較好。取葡聚糖Sephardex G-75干粉,加過(guò)量的蒸餾水室溫充分溶脹一天(溶脹時(shí)間因凝膠交聯(lián)度不同而不同),或沸水浴中溶脹3小時(shí),這樣可大大縮短溶脹時(shí)間,而且可以殺死細(xì)菌和霉菌,并可排出凝膠內(nèi)氣泡。溶脹過(guò)程中注意不要過(guò)分?jǐn)嚢?,以防顆粒破碎。待溶脹平衡后用傾瀉法除去不易沉下的細(xì)小顆粒,最后凝膠經(jīng)減壓抽氣除去氣泡,即可準(zhǔn)備裝柱。
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